Po svém dokončení v roce 1592 a následném zasvěcení se Maiselova synagoga stala největší budovou pražského ghetta a díky bohaté výbavě také tou nejhonosnější.

Během nacistické okupace byl v Maiselově synagoze uložen konfiskovaný židovský majetek. V roce 1955 ji pak získalo Židovské Muzeum v Praze pro svůj depozitář.

Dnes si zde návštěvníci mohou prohlédnout audiovizuální 2D projekci, díky které se projdou uličkami starého Židovského Města ve slavném Langweilově modelu Prahy.