Pojmenování „Na Slupi“ pochází ze staročeského „slup“ (sloup), protože klenba kostela spočívá na jediném pilíři. Podle jiného výkladu dnešní obvyklé pojmenování má původ v 16. století a je odvozeno od slupů – nádrží na ryby, které byly v umístěny nedalekém Botiči.

Kostelu dominuje 38 metrů vysoká štíhlá věž, která je nakloněna o 63 cm do ulice Na Slupi a má největší odklon od své svislice ze všech pražských věží.

Legenda praví, že Karel IV. klášter založil poté, co po své nemoci přislíbil před obrazem ve florentském klášteře servitů, že i u nás založí klášter tohoto řádu, jako dík za své uzdravení.