Stavbu klášterního kostela inicioval v roce 1253 opat břevnovských benediktinů Martin I. na místě dřívější dřevěné kaple. Nově vystavěný gotický kostel byl zasvěcen Nanebevzetí Panny Marie. Monumentální stavba nesla románské a gotické znaky, u nás je tento stavební styl označován jako přemyslovská gotika.

Byť kostel Nanebevzetí Panny Marie v historii prošel ohněm i přestavbami, některé jeho nejstarší části se přesto dochovaly - jednak jsou to boční lodi kostela, jednak kněžiště zaklenuté původní křížovou gotickou klenbou, ale i vzácný raně goticky lomený portál s realistickým rostlinným dekorem.

Nejtěžším obdobím se pro polický kostel Nanebevzetí Panny Marie staly husitské bouře v 15. století. Tehdy vojska katolických Slezanů celé město vydrancovala a místní obyvatele vyvraždila. Vypálen byl i polický klášter s kostelem. Kvůli tomu se v hlavní lodi zřítila klenba, která byla později nahrazena stropem z prken, položených na starých gotických obloucích. Oheň kostel zachvátil znovu v druhé polovině 16. století.

Radikálnější proměna kostela Nanebevzetí Panny Marie přišla na počátku 18. století - tehdy byl kostel barokně přestavěn. Na konci 19. století byl upraven znovu, tentokrát v pseudogotickém stylu.