Roku 1770 se zřítilo celé kněžiště a kostel byl po opravách v roce 1777 znovu vysvěcen již v barokním slohu. Při velkém požáru Třeště 1. října 1824 vyhořel i svatokateřinský kostel s vnitřním vybavením a zřítily se i oba jeho zvony.

Roku 1842 byl kostel obnoven a dostal nové varhany, které slouží dodnes. Oprava věže byla dokončena až v roce 1870, kdy cibulovitou střechu nahradila jehlanová.

V roce 1889 byly pořízeny 3 nové zvony: Kateřina - 887 kg, Leopold - 390 kg, Filip a Jakub - 338 kg. Tyto zvony byly zabaveny v roce 1914 pro válečné účely. Roku 1930 proto byly pořízeny 3 nové zvony, o které však kostel opět přišel v roce 1942, kdy byly a odvezeny do Hamburku, odkud se již nevrátily. Od roku 1995 visí v kostele zvon Kateřina.

Na zdi kostela je náhrobek neznámého rytíře. Není známo z jaké doby pochází či komu patří, ale pravděpodobně půjde o někoho z rodu Lipovických z Lipovic.

Kostel je přístupný po domluvě v TIC Třešť.