Oblast Svatého kopečku dříve sloužila jako pastvina pro dobytek a v severovýchodní části kopce se od roku 1816 těžil vápenec. Po ukončení těžby byl lom uměle zalesněn a dnes zde má své hnízdiště výr velký. Samotná rezervace je pak domovem stepních teplomilných druhů rostlin a menších živočichů.

Svatý kopeček je také poutním místem, na které vede křížová cesta (pouť k mikulovské Černé madoně loretánské), na jehož vrcholku nechal v roce 1623 postavit Kardinál Dietrichstein kapli sv. Šebestiána jako poděkování za ochranu města před morovou epidemií.

Vedle kaple stojí zvonice z roku 1632, v níž se původně nacházely dva zvony. Ty se po úderu blesku a následném požáru roku 1767 roztavily. Později je nahradil velký zvon o hmotnosti 4360 kg a průměru 185 cm, který byl ulit z původních zvonů. K jeho rozhoupání je potřeba čtyř zvoníků.