Příroda se v borkovických blatech vyvíjela v atypických podmínkách. V močálech a zamokřených lokalitách se dařilo jen různým mechům, rákosu a jiným vlhkomilným rostlinám. Jejich zbytky se v blatenské půdě, která byla chudá na kyslík, nemohly dostatečně rozkládat a proto rašeliněly. Vznikla zde tak vrstva rašeliny o mocnosti 2-6 metrů.

V Borkovických blatech je čím se kochat po celý rok. Na jaře tu kvetou bílé okolíky rojovníku, v červnu kvetou klikvy a bublinatky a na podzim jsou na mechových polštářích k vidění bobule klikve.

Přírodní rezervací Borkovická Blata také prochází téměř 4 kilometry dlouhá stejnojmenná naučná stezka z povalových chodníčků. Informační panely návštěvníky seznámují s místní florou a faunou, historií těžby rašeliny a následnou rekultivaci této krajiny.